辦理三類醫療器械經營許可證需要按照以下步驟進行：

1. 準備材料：

- 申請表格（可以從國家藥品監督管理局guanfangwangzhan下載）

- 法定代表人或負責人的身份證明材料

- 公司的營業執照副本復印件

- 經營場所租賃合同復印件

- 經營設施和儀器設備清單

- 質量管理體系文件

- 售后服務部門設置方案

- 相關的產品質量、安全性、有效性文件材料

2. 填寫申請表格：

根據要求填寫申請表格，并逐項準確填寫所需信息。

3. 提交申請材料：

將準備好的申請材料提交給當地市場監管部門。

4. 審核和核準：

當地市場監管部門將對提交的申請材料進行審核，并進行現場檢查。

5. 發放許可證：

審核通過后，市場監管部門將發放三類醫療器械經營許可證。

以上是一般的辦理流程，具體的要求可能會因地區和具體政策而有所差異。